Хочу у нотариуса заверить подпись на договоре к/продажи авто за 100р., а не сам договор за 1% от его суммы, можно так?

Не получится. договор нотариус удостоверяет.
нотариальное действие, которое вы бы хотели совершить называется "свидетельствование" подлинности подписи на документе, содержание которого не противоречит законодательным актам российской федерации.
нотариус, свидетельствуя подлинность подписи, не удостоверяет фактов, изложенных в документе, а лишь удостоверяет, что подпись сделана определенным лицом.

этот документ не будет договором, это будет обычным заявлением о чем-то, подписанное вами. совсем разные вещи. продайте а/м через комиссионный магазин (должен быть при любом гаи)