Какой срок лучше прописывать в договоре поставки

Принципиальной разницы нет. если, конечно, обе стороны договора находятся в россии.
если контрагент иностранный, то при формулировке про рабочие дни возникает нюанс, что в разных странах разные праздники. в этом, на мой взгляд, нет ничего страшного, но это придется учитывать, чтобы понимать реальные сроки. из-за таких различий дата может немного "гулять". хотя это обычно крайний срок и по факту поставка осуществляется раньше.
я бы лучше прописывал календарные дни. это как-то конкретней.