С какого момента договор энергоснабжения между сторонами считается заключенным, если имелись протоколы разногласий?

С момента подписания самого договора. Наличие протокола разногласий ( не предусматривающего изменение срока договора) не меняет его сроки. Протоколом вы исключаете или изменяете некоторые условия. Как правило договор подписывается одновременно с протоколом. В договоре делается ссылка, что он подписан с протоколом разногласий.Контрагент может подписать договор, но не подписать протокол разногласий, тогда договор считается заключенным, но не согласованным по отдельным пунктам. В этом случае, по спорным вопросам суд будет руководствоваться действующим законодательством.