У меня есть договор купли-продажи и акт приемки нежилого здания.

Смотря что вы понимаете под словом - завладел! если юридически, то значит у него тоже есть подтверждающие на то документы. судитесь, эти доки признают не действительными и он лишиться все прав. а если еще и физически, т. е. препятствует вашему нахождению на территории объекта, после решения суда смело захватывайте здание. выгонять конечно никого не стоит, а вот ночью спилить двери и сменить замки - имеете полное право, и не пустить никого разумеется тоже. мало того, имущество находящееся на территории вашего помещения, так же через суд, совершенно законно (т. к. они там оказались без вашего ведома и согласия) оформить, как находку! )))
и оно перейдет к вам в собственность. отсутствие свидетельства не влияет на ваши права собственности. договор уже подписан!! ! не забывайте вы - собственник! гоните в шею!