У моего отца друг был ответчиком в суде. Сколько раз прокурор в суде по гражданским делам может давать отвод?

Раз пять-шесть у Вас скорее всего были заседания, а не процессы. Отвод суду и иным лицам, участвующим в деле, дается перед началом заседания, тогда назначается другой состав суда, дело подлежит рассмотрению с самого начала. И судья может заявить самоотвод. Так что Ваш вопрос здесь - это испорченный телефон, кто-то что-то где-то недопонял, недослышал, не так пересказал, неправильно употребил термин. В результате десять человек здесь теряют время, пытаясь понять, что у Вас там случилось. Посерьезнее хотелось бы.