Если ген.д-р оформлен в неком.орг.,хотя без решения общ.собрания (фз о нек.орг.) и при этом еще получает 80 тыс., а

В некоммерческих организациях по закону избирается общим собранием правление и его председатель, они -то и являют собой исполнительный орган. Впервые конечно слышу, что в некоммерческой организации работает ген.директор... Но, если работает и должность так называется значит есть трудовой договор, и соответственно, ему обязаны платить зарплату. Полагаю договор с ним заключал председатель правления некоммерческой организации, изучаем условия, находим "повод для увольнения" и расторгаем договор. А вот зарплату через суд работодатели не возвращают.