Что делать если магазин в другом городе отказывается отдавать транспортной компании товар который оплачен?

На основании чего отказываются выдать? у вашего водителя, если товар забирает он -должны быть документы, подтверждающие, что он представитель получателя, т. е., если получатель ооо пупкин, то у водителю без доверки с печатью от ооо пупкин товар не выдадут -это законно со стороны транспортной компании.