Несет ли юридическое лицо стоящее выше другого юр лица?

Полный сумбур. но как понял. нижестоящая организация не филиал, не обособленное подразделение и не представительство, а дочка ООО или ЗАО (ОАО). В этом случае доверенность действительна только от руководителя дочки, имеющего право на выдачу таких доверенностей по Уставу дочки. В крайних сложных финансовых ситуациях основное ООО несет обязательства в отношении дочки только в пределах суммы заявленного уставного капитала (ее части). Если здесь присутствует схема внешнего управления обществом, т.е. исполнительным органом ее является другое ООО в лице его директора, тогда да - по такой доверенности будет нести ответственность и основное ООО в части убытков, нанесенных по его вине.