В марте 2012 года продали автомобиль.

По закону плательщиком транспортного налога является лицо, на которое зарегистрировано транспортное средство.
именно для того, чтобы избежать подобных ситуаций, нужно снимать машину с учета.
но это к слову.
по существу:
1. срок уплаты транспортного налога - следующий год, т. е. налог уплачивается не за текущий, а за предыдущий год.
в этом году пришел налог за 2012-ый год. в то время - пусть и всего три месяца - машина была вашей. следовательно, требование уплатить налог за этот период - вполне законно.
2. если налог вам рассчитан за весь 2012 год, а не за три месяца - следует обратится в налоговую инспекцию с заявлением и копией договора. должны пересчитать.