Если покупаю квартиру с мебелью. договор составлять отдельно на квартиру отдельно на мебель?

Да без разницы. пользуясь свободой договора, про мебель можно сделать отдельную главу, всего то и делов. поскольку это не противоречит положениям ГК, регистраторы ОБЯЗАНЫ будут его зарегистрировать. Только к чему такие вопросы вообще - пусть юрист, который составляет договор, Вам все объяснит и сам сделает, продажей недвижимости самому заниматься вряд ли стоит - цена вопроса слишком высокая