Можно написать в одном заявлении на индексацию присужденных денежных сумм и проценты по ст. 395 ГК РФ?

Можно, но лучше двумя разными заявлениями оформить, так как, ст. 395 ГК РФ предусматривает, что обязательно нужно оплатить госпошлину от суммы заявленных требований (мин. 200 руб.). Кроме того, в ст. 208 ГПК РФ зафиксировано право взыскателя на индексацию присужденных сумм с момента вступления Решения суда в законную силу до момента его фактического исполнения. Суд может удовлетворить и индексацию, и проценты.