Как право собственности на учреждение может перейти к другому лицу? учреждение же это субъект права, а

Учреждение - это юридическое лицо, и, как вы правильно заметили, конечно, не может являться объектом права собственности. если вы имеете в виду предприятие, как имущественный комплекс (земля, недвижимость, оборудование и т. п.), то оно может передаваться, например, по договору купли-продажи предприятия (параграф 8 гл. 30 гк рф)