Если копания хочет экономить на уплате налогов, что выгоднее для нее: заключить с работником (менеджер, дворник и т.д.)

Да, практически, без разницы. с договора подряда только ФСС 2,9% уплачивать не будете, всё остальное в общем порядке. по договору подряда "работникам" больничные и отпуска не положены. только при проверке ФСС будет пытаться переквалифицировать ваши договоры подряда в договоры трудовые и если у них это получится (а при активной поддержке работников - скорее всего получится), то и ФСС придется взносы уплатить, и работникам какой-нибудь материальный ущерб, да еще, может и штраф какой "нарисуют". если уж заключать договор гражданско-правового характера, то не с физ.лицом, а с ИП. печники сами за себя ответственность несут, налоги платят и отчитываются.