Как оформить право собственности на нежилое помещение без фундамента?

Фундамент не имеет самостоятельного значения. Как я понимаю, тебе на самом деле нужно установление статуса "недвижимость" на строение; для этого необходимо, чтобы строение не могло быть перемещено без его разрушения, а этого можно добиться разными способами. Например, забив глубокие сваи и приварив к ним строение. Конечно, фундамент в смысле доказательности "фундаментальнее" и имеет бОльший вес.